新冠病毒韧性的基因：识别与冠状病毒抗性和易感性相关的DNA标记

冠状病毒（CoVs）（目Nidovirales，科Coronaviridae，亚科Coronavirinae）是许多脊椎动物物种呼吸道疾病疫情的元凶。它们是一大类单链RNA包膜病毒（+ssRNA），可以在不同动物物种中分离得到。它们的基因组大小在26到32千碱基（kb）之间，是RNA病毒中基因组最大的（因此提高了口罩的有效性）。 COVID-19，也称为严重急性呼吸综合症冠状病毒2型（SARS-CoV-2），或“2019新型冠状病毒”，是一种新病毒，我们刚刚开始理解人类的抗性和易感性。

COVID-19在某种程度上与严重急性呼吸综合症（SARS）相似，因为这两种病毒都通过相同的受体——血管紧张素转化酶2（ACE2受体）感染人类宿主，并导致类似的临床和病理特征。有趣的是，负责受体结合的刺突蛋白在2019-nCoV和SARS-CoV之间高度相似，这是由于对相同受体的显著选择所致（Wu., 2020）。研究我们的身体如何抵御SARS可能会揭示我们的身体如何抵御COVID-19。

最近的几项全基因组关联研究（GWAS）提供了更深入的见解，帮助解释为什么有些个体几乎不受COVID-19影响，而对其他人来说，这种病毒则是威胁生命甚至致命的。

在这篇文章中，我们提供了经过同行评审的文献综述，并介绍了与SARS-CoV抗性相关的候选基因信息。如果您曾在家中进行过DNA测试，例如23andMe、Ancestry DNA或Dante labs提供的测试，您可以评估您的原始DNA数据，并查看您的DNA序列与研究结果的比较。

如何分析您的DNA以抵抗或易感于冠状病毒？

步骤 1) 下载您的原始常染色体DNA文件并将其保存在安全的位置

要分析您的DNA数据，首先下载您的原始常染色体DNA并将其保存在安全的位置。 以下是从下载您的原始DNA文件的说明： 23andMe, Ancestry DNA, Family Tree DNA, Dante Labs, My Heritage, Genes For Good, Vitagene, and Living DNA.

步骤 2) 分析您的原始 DNA 文件

使用文本编辑器，如“文本编辑器”或“记事本”，通过“查找”功能或命令行搜索您的原始DNA数据。

打开您的原始DNA文件，您会注意到独特的SNP ID (rs# 或 i#)、染色体、位置和基因型的标题。不同的直接面向消费者的DNA测试公司之间格式略有不同。

要评估您从COVID-19中恢复不良的风险，请查看以下描述的DNA标记：

最近发表了几项全基因组关联研究（GWAS），描述了与感染SARS-CoV-2的患者呼吸衰竭相关的位点，并且三项研究在同一约50 kb的基因组片段中识别了SNP标记，该片段是从尼安德特人那里遗传而来的。

此外，本帖中提到的其他DNA标记包括与SARS相关的rs4804803，以及位于血管紧张素转化酶2（ACE2）受体上的标记，该受体被证明是人类呼吸道冠状病毒NL63、SARS冠状病毒（SARS-CoV）和2019新型冠状病毒2019-nCoV/SARS-CoV的相同受体（Li et al., 2017; Lu et al., 2019）。由于冠状病毒的刺突蛋白已经进化以匹配ACE2受体，因此具有改变蛋白质序列的变异个体可能会对COVID-19产生一定的抵抗力。以下是来自ACE2转录本NM_021804.2的非同义SNP，特别值得关注的是导致重大变化的SNP，如rs199951323，它会导致提前终止密码子。