Genar fyrir covid-19 þol: greining á DNA merkjum sem samsvarar mótefni gegn koronaveiru og næmleika.

Koronaveirur (CoVs) (röð Nidovirales, fjölskylda Coronaviridae, undirfjölskylda Coronavirinae) eru ábyrgir fyrir útbrotum af öndunarfærasjúkdómum hjá mörgum hryggdýrategundum. Þeir eru stór fjölskylda af einþráða RNA umhverfisveirum (+ssRNA) sem geta verið einangraðir í mismunandi dýrategundum. Þeir hafa erfðamengi sem er milli 26 og 32 kilobasa (kb) í lengd, sem gerir þá að stærstu erfðamengjum RNA veira (sem þar með aukar áhrifsvæði grímur). COVID-19, einnig þekkt sem alvarlegur akútur öndunarfærasjúkdómur koronaveiru 2 (SARS-CoV-2), eða "ný koronaveira 2019", er ný veira og við erum að byrja að skilja þol og næmni hjá mönnum.

COVID-19 er líkt alvarlegu akútu öndunarveiru (SARS) í þeim tilliti að bæði veirurnar sýkja mannlega gesti sína með sama viðtaka, angiotensin-umbreytandi ensím 2 (ACE2 viðtaki), og valda svipuðum klinískum og patólogískum einkennum. Áhugavert er að spík prótein, sem er ábyrgt fyrir viðtaka tengingu, er mjög líkt milli 2019-nCoV og SARS-CoV, þetta er afleiðing mikils valdar fyrir sama viðtaka (Wu., 2020). Rannsóknir á því hvernig líkaminn okkar verndar sig gegn SARS gætu leitt til þess að við lærum hvernig líkaminn okkar getur verndað sig gegn covid-19.

Fjöldi nýlegra rannsókna á erfðamengi hefur veitt miklu dýpri innsýn í erfðabreytingar sem geta hjálpað til við að útskýra af hverju sumir einstaklingar eru næstum óháðir af COVID-19, en fyrir aðra er veiran lífshættuleg eða jafnvel banvæn.

Í þessari pistli veitum við yfirlit yfir fagfelldar rannsóknir og birtum upplýsingar um mögulega gen fyrir SARS-CoV ónæmi. Ef þú hefur tekið heima DNA próf eins og þau sem eru í boði frá 23andMe, Ancestry DNA, Dante labs, getur þú metið hráa DNA gögnin þín og séð hvernig DNA röðin þín ber saman við rannsóknarniðurstöðurnar.

Hvernig á að greina DNA þitt fyrir mótefnavirka eða næmni fyrir koronaveiru?

Skref 1) Hlaðið niður hráa autosómísk DNA skrána ykkar og vistaði hana á öruggum og öruggum stað. Til að greina DNA gögnin ykkar, byrjið á því að hlaða niður hráa autosómísk DNA skrána ykkar og vista hana á öruggum stað. Hér eru leiðbeiningar til að hlaða niður hráa DNA skrána ykkar frá: '. 23andMe, Ancestry DNA, Family Tree DNA, Dante Labs, My Heritage, Genes For Good, Vitagene, and Living DNA.

Skref 2) Greina hráa DNA skrána þína.

Leitaðu í hráa DNA gögnin þín með textaritli eins og "text wrangler" eða "notepad" með því að nota "finna" fallið, eða með því að nota skipanalínu.

Opnaðu hráa DNA skrána þína og þú munt sjá hausana á einstökum SNP auðkenni (rs# eða i#), litning, staðsetningu og genótýp. Sniðin eru aðeins mismunandi milli hvers einasta fyrirtækis sem framkvæmir DNA próf fyrir neytendur.

Til að meta áhættu þína á slæmri endurheimt frá COVID-19, leitaðu að eftirfarandi DNA merkjum lýst hér að neðan:

Margir rannsóknir á heildar erfðagreiningu (GWAS) voru nýlega birtar sem lýsa staðsetningum tengdum öndunarbilun hjá sjúklingum sem smitast af SARS-CoV-2 og þrjár rannsóknir fannu SNP merki í sama ~50 kb erfðamengi sem er erfðað frá Neandertölum. ' (Ellinghaus D et al., 2020, Zeberg & Pääbo, and Blokland et al., 2020). Auk þess hefur þessar GWAS rannsóknir einnig greint fjölda annarra DNA merkja sem tengjast COVID-19, og hver þeirra er birt í töflunni hér að neðan.

Auk þess, eru aðrir DNA merki sem fjallað er um í þessari grein innihalda rs4804803 sem var tengt við SARS, og þau sem staðsett eru í angiotensín-umbreytandi ensími-2 (ACE2) viðtakanum sem var sannað að vera sama viðtaki fyrir mannlega öndunarflogaveiruna NL63, SARS-koronaveiruna (SARS-CoV) og nýja koronaveiruna 2019-nCoV/SARS-CoV (Li et al., 2017; Lu et al., 2019). Þar sem spíkpróteinið á koronaveirunni hefur þróast til að passa við ACE2 viðtakann, er líklegt að einstaklingar með breytingar sem hafa áhrif á röð próteinsins myndu leiða til ákveðins gráðu af ónæmi við covid-19. Hér fyrir neðan eru ekki-samhverfar SNPs frá ACE2 umritinu NM_021804.2 og sérstaklega áhugavert eru SNPs sem valda miklum breytingum eins og rs199951323 sem leiðir til fyrirbærs stoppmerkis.